Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms