Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RNF185Q96GF1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms