Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OTUB1Q96FW1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OTUB1Q96FW1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms