Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC51Q96ER9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC51Q96ER9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms