Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM44Q96DX7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM44Q96DX7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms