Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG4CQ96DT6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms