Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
C18orf8Q96DM3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C18orf8Q96DM3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms