Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RUNDC1Q96C34 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RUNDC1Q96C34 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms