Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMIGD2Q96BF3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMIGD2Q96BF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms