Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM54Q969K7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEM54Q969K7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms