Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RNF34Q969K3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms