Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HERVK_113Q902F9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms