Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45GIP1Q8TAE8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms