Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NUP35Q8NFH5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NUP35Q8NFH5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms