Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU8

LINC00116, Uncharacterized protein encoded by LINC00116, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00116Q8NCU8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LINC00116Q8NCU8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LINC00116Q8NCU8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms