Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARRDC4Q8NCT1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms