Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL8

TMEM116, Transmembrane protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116Q8NCL8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM116Q8NCL8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM116Q8NCL8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms