Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACBD4Q8NC06 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms