Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PNLDC1Q8NA58 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PNLDC1Q8NA58 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms