Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC63Q8NA47 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC63Q8NA47 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms