Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL2Q8N4E4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDCL2Q8N4E4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms