Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PROM2Q8N271 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PROM2Q8N271 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms