Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMNTD2Q8IXW0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms