Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNL1Q8IU54 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNL1Q8IU54 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms