Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB11FIP4Q86YS3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP4Q86YS3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
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