Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LCA5Q86VQ0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms