Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC84Q86UT8 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms