Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9AQ7Z3C6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG9AQ7Z3C6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms