Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP50Q70EL3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP50Q70EL3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms