Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM43BQ6ZT52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms