Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM136Q6ZRR5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms