Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UQCC3Q6UW78 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UQCC3Q6UW78 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms