Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ATRAIDQ6UW56 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms