Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC137Q6PK04 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC137Q6PK04 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms