Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 UBR4-201ENST00000375218 4031 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.432e-7■■■■■ 38.9
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PRPF8Q6P2Q9 TAF15-201ENST00000603067 580 ntTSL 52.67□□□□□ -1.981e-7■■■■■ 38.9
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PRPF8Q6P2Q9 COG1-202ENST00000438720 4051 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 38.7
PRPF8Q6P2Q9 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.84e-7■■■■■ 38.7
PRPF8Q6P2Q9 COG1-210ENST00000618996 3369 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 38.7
PRPF8Q6P2Q9 CENPM-202ENST00000396437 689 ntTSL 39.7□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 38.7
PRPF8Q6P2Q9 STAT2-204ENST00000555519 588 ntTSL 58.17□□□□□ -1.14e-10■■■■■ 38.7
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PRPF8Q6P2Q9 ASMTL-203ENST00000462195 573 ntTSL 218.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 38.7
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PRPF8Q6P2Q9 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 27.79□□□□□ -1.162e-10■■■■■ 38.6
PRPF8Q6P2Q9 PSMA2-205ENST00000457444 801 ntTSL 36.19□□□□□ -1.423e-8■■■■■ 38.6
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