Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZN7

HCP5, HLA class I histocompatibility antigen protein P5, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCP5Q6MZN7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HCP5Q6MZN7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HCP5Q6MZN7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms