Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SDE2Q6IQ49 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SDE2Q6IQ49 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms