Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBS0

TWF2, Twinfilin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF2Q6IBS0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TWF2Q6IBS0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TWF2Q6IBS0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms