Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB3L3Q68CJ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB3L3Q68CJ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms