Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ECM29Q5VYK3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ECM29Q5VYK3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms