Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC01545Q5VT33 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms