Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C12orf60Q5U649 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C12orf60Q5U649 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms