Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MARCH8Q5T0T0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH8Q5T0T0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms