Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SZT2Q5T011 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SZT2Q5T011 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms