Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC39AQ5SRH9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TTC39AQ5SRH9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms