Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ODF2Q5BJF6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ODF2Q5BJF6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms