Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDCCQ504Y2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDCCQ504Y2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms