Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A12Q504Y0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms