Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF212Q495C1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms