Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BBS9Q3SYG4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms